Luiz Franchini

Ensaio dia 03/03

Filogenias representam inferências sobre relações de parentesco e ancestralidade em comum entre dados. Estes dados são principalmente moleculares e/ou morfológicos. Normalmente, há combinação de parâmetros a respeito dos dados para posicionamento dos terminais e nós em uma representação gráfica. Os terminais são os fatos observados. Os nós são ferramentas hipotéticas na construção das filogenias. Não há uma forma única e consensual de construir uma filogenia. Existem diversos métodos para tal, que podem ser usados com diferentes finalidades. Dependendo de qual é o objetivo da pesquisa, um método é preterido em detrimento de outro.

Ensaio dia 10/03

Antes da existência de dados moleculares, o principal método usado na construção de filogenias eram dados morfológicos. Estes dados muitas vezes são enganosos e levam a relações de parentesco não existente entre organismos. Os dados moleculares utilizados hoje pelos sistematas são sequências de aminoácidos ou de núcleotídeos de DNA/RNA. A comparação de sequências é feita, principalmente, com o alinhamento de regiões homólogas de aminoácidos/nucletídeos. Após a análise, é possível estabelecer relações de parentesco e testar se elas corroboram ou não as relações evolutivas propostas pela análise de outros dados. Assim, a utilização de dados moleculares mudou a forma como filogenias são construidas. Seu uso pode dar mais suporte a um clado, ou mostrar a necessidade de revisão.

Ensaio dia 17/03

Muitos parasitologistas ainda usam a classificação dos 5 Reinos proposta por Whittaker. Uma consequência disso é o agrupamento de diversos parasitas não-aparentados (de acordo com dados recentes) na base da filogenia, em que seus organismos de interesse representam eucariotos primitivos (Walker et al.; 2011). Como essa área de estudo é, em geral, baseada na análise de um ou poucos organismos, uma forma alternativa para complementar a parasitologia é a aplicação de filogenias modernas. Isso pode destacar caminhos evolutivos e proporcionar uma visão mais ampla da área. Dessa forma, é possível que o uso de filogenias modernas permitirá a formulação de hipóteses sobre modos de parasitismo encontrados em organismos aparentados e meios de combatê-los.

Comentários por Arlúcio (05/05): Oi Luiz, tudo bom? Gostei bastante do seu texto, porém tenho apenas 3 apontamentos: i) Você fez uma referência no começo do parágrafo, porém esqueceu de citar ela no final. Pensando que alguém de fora esteja lendo, essa pessoa teria dificuldades em encontrar o trabalho citado; ii) Na última frase, eu fiquei com uma impressão que você comeu algum verbo logo após "possível". Imagino que seria algo como "inferir" ou sinônimos deste. Caso não tenha comido o verbo, então é bom dar uma relida e ajustar a concordância entre as palavras pois ficou um pouco estranho de se ler; por fim, iii) de quais parasitas se trata a problemática? Não está tão claro e ter demonstrado com exemplos os nomes de alguns daria mais clareza pro entendimento do texto.

Ensaio dia 14/04

Nos estudos paleontológicos, é recorrente a aparição de organismos extintos que são denominados como "grupos tronco", do inglês stem groups. Em geral, os grupos tronco são caracterizados a partir de fósseis muito antigos, datados a partir de estratigrafia, datação isotópica, dentre outros métodos. Esses organismos possuem caracteres suficientes para classificá-los como membros de algum grande grupo biológico - eucariontes, por exemplo -, porém não é possível estabelecer afinidade com nenhuma linhagem moderna. Apesar disso, pesquisadores podem aplicar esses conhecimentos em inferências sobre o momento de eventos marcantes na história evolutiva da vida terrestre, como, por exemplo, o surgimento de grandes grupos extantes.

Comentário por Bruna (28/04): Eu gostei bastante do texto. Acho que você escolheu um assunto bem difícil de elucidar sem a utilização de imagens. Mas, para mim, o texto ficou um pouco confuso em alguns momentos. Por exemplo, o que você quis dizer com "os grupos tronco são caracterizados a partir de fósseis muito antigos"? E com "pesquisadores podem aplicar esses conhecimentos em inferências sobre o momento de eventos marcantes na história evolutiva da vida terrestre"? De quais conhecimentos você está falando? Além disso, o Daniel falou sobre a importância de definirmos os conceitos que vamos apresentar e acho que a definição de "grupos extantes" seria importante.

Aula invertida 12/05

Para essa aula, pensei em iniciar com uma ideia geral sobre a fotossíntese oxigênica. Explicar brevemente o funcionamento dos fotossistemas e ressaltar a importância da fotossíntese para a vida como conhecemos. Depois desse momento, discutir as principais hipóteses sobre a evolução dos grupos de procariotos fotossintetizantes e os problemas provocados pelas transferências laterais, como descrito em Xiong (2006), utilizando a figura 1 desse artigo.

A partir disso, discutir os diversos tipos de registros fósseis existentes e a polêmica por trás do momento do surgimento da fotossíntese, como discutido em Leslie (2009). Falar também sobre a relação dos procariotos fotossintetizantes com os eucariotos a partir dos eventos de endossimbiose, como descrito em McFadden (2001), utilizando a figura 1 do artigo.

Finalizar a aula indicando o que conseguimos concluir sobre o assunto até agora e alguns aspectos de pesquisas futuras, sugerido por Xiong (2006).

Referências
Leslie, M. 2009. On the Origin of Photosynthesis. Science. 323:1286-1287
McFadden G. I. 2001. Primary and Secondary Endosymbiosis and the Origin of Plastids. J. Phycol. 37:951-959
Xiong, J. 2006. Photosynthesis: what color was its origin? Genome Biology. 7:245.1-245.5

Comentários sobre a aula proposta 19/05

Pensando no número de conceitos fundamentais para minha aula proposta, encontro 4: o funcionamento dos fotossistemas; diferentes hipóteses sobre evolução de procariotos fotossintetizantes; registros fósseis e suas polêmicas; e eventos de endossimbiose de procariotos fotossintetizantes com eucariotos. Para enxugar essa aula, eu penso em tirar a parte dos fotossistemas e dos eventos de endossimbiose. Pensando no tempo, seria necessário abordar pouco das polêmicas sobre a evolução dos procariotos fotossintetizantes pois é assunto para uma vida de pesquisa.

Sendo assim, a aula ficaria disposta nas seguintes etapas:

  • Introdução com importância da fotossíntese para a vida terrestre
  • Breve discussão a respeito da evolução dos procariotos fotossintetizantes
  • Associada a discussão evolutiva, mostrar o que podemos entender a partir do registro fóssil
  • Finalizar indicando aspectos para pesquisas futuras
Unless otherwise stated, the content of this page is licensed under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 License